UNAFold

UNAFold

RNAやDNAの二次構造を予測するプログラムとして代表的なmfoldの後継ソフトウェア。

無料でUNAFoldから入手できる。

2008/04/11時点でのファイル名は、

unafold-3.5.tar.gz

perlで書かれていてソースコードからコンパイルする必要がある。

解凍後 unafold-3.5フォルダに移動して

$ ./configure
$ make
$ make install

で/usr/local/binにインストールされる。

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Citations

• Markham, N. R. & Zuker, M. (2005) DINAMelt web server for nucleic acid melting prediction. Nucleic Acids Res., 33, W577-W581.