Treefinder

Treefinder

最尤法を用いた系統解析プログラム。私の知る限りでは最速(あまり試してませんが)。何よりインストールと使い方が簡単なのでお勧めです。
無料でTreefinderから入手できる。

2007/07/06時点でのファイル名は、

tf-june2007-mac-intel-binary.zip

解凍するとマニュアルが入っているので、これに従って作業をする。
解凍したフォルダをアプリケーション(Applications)に移動。
ターミナルで

$ cd /Applications
$ chmod -R a=rx Treefinder
$ cd Treefinder
$ sudo ln -f ./tf /bin/tf
$ sudo ln -f ./treefinder /bin/treefinder

これでインストール終了。

実行はターミナルを立ち上げて、

$ treefinder

---

Citations

• Jobb, G., A. von Haeseler, and K. Strimmer. TREEFINDER: A powerful graphical analysis environment for molecular phylogenetics. 2004. BMC Evolutionary Biology.